| Eupatorium pseudoperfoliatum Sch. Bip. ex Klatt, 1884 |
| Eupatorium ptaretepuiense V.M. Badillo, 1946 |
| Eupatorium pulchellum Kunth, 1818 |
| Eupatorium pulchellum var. angustifolium S. Watson ex B.L. Rob., 1916 |
| Eupatorium punctatum Mill., 1768 |
| Eupatorium purpusii Brandegee, 1899 |
| Eupatorium purpusii var. monticola Brandegee, 1899 |
| Eupatorium pycnocephaloides B.L. Rob., 1916 |
| Eupatorium pycnocephalum Less., 1831 |
| Eupatorium pycnocephalum var. glandulitectum B.L. Rob., 1923 |
| Eupatorium quadrangulare DC., 1836 |
| Eupatorium quercetorum L.O. Williams, 1975 |
| Eupatorium quinquesetum Benth., 1853 |
| Eupatorium rafaelense J.M. Coult., 1891 |
| Eupatorium raffillii Hemsl., 1908 |
| Eupatorium ramireziorum Espinosa, 1984 |
| Eupatorium ramonense B.L. Rob., 1909 |
| Eupatorium rapunculoides (DC.) B.L. Rob., 1906 |
| Eupatorium ravenii (R.M. King & H. Rob.) B.L. Turner, 1989 |
| Eupatorium reyrobinsonii (B.L. Turner) B.L. Turner, 1989 |