| Eupatorium arsenei B.L. Rob., 1934 |
| Eupatorium aschenbornianum Schauer, 1847 |
| Eupatorium astellerum B.L. Turner, 1977 |
| Eupatorium atrocordatum B.L. Rob., 1934 |
| Eupatorium atrorubens G. Nicholson, 1885 |
| Eupatorium azureum DC., 1836 |
| Eupatorium bartlettii B.L. Rob., 1932 |
| Eupatorium bellidifolium Benth., 1840 |
| Eupatorium berlandieri DC., 1836 |
| Eupatorium bertholdii Sch. Bip., 1856 |
| Eupatorium bertholdii var. stenophyllum Sch. Bip., 1856 |
| Eupatorium betonicifolium Mill., 1768 |
| Eupatorium bigelovii A. Gray, 1859 |
| Eupatorium billbergianum Beurl., 1856 |
| Eupatorium bimatrum Standl. & L.O. Williams, 1952 |
| Eupatorium blakei B.L. Rob., 1920 |
| Eupatorium blepharilepis Sch. Bip., 1856 |
| Eupatorium bohlmannianum (R.M. King & H. Rob.) B.L. Turner, 1997 |
| Eupatorium brandegeanum B.L. Rob., 1923 |
| Eupatorium braunii Pol., 1877 |