| Maxillaria punctostriata Rchb. f., 1876 |
| Maxillaria rhombea Lindl., 1840 |
| Maxillaria ringens Rchb. f., 1863 |
| Maxillaria rousseauae Schltr., 1918 |
| Maxillaria rubrilabia Schltr., 1923 |
| Maxillaria scorpioidea Kraenzl., 1911 |
| Maxillaria sessilis (Sw.) Fawc. & Rendle, 1910 |
| Maxillaria seymouriana J.T. Atwood, 1981 |
| Maxillaria simulans (Ames & C. Schweinf.) L.O. Williams, 1956 |
| Maxillaria skinneri Bateman ex Lindl., 1842 |
| Maxillaria soconuscana Breedlove & D. Mally, 1989 |
| Maxillaria sotoana Carnevali & Gómez-Juárez, 2001 |
| Maxillaria stachyobiorum Rchb. f., 1852 |
| Maxillaria sulfurina Lem., 1848 |
| Maxillaria superba Lex., 1825 |
| Maxillaria tenuifolia Lindl., 1837 |
| Maxillaria tonsoniae Soto Arenas, 1992 |
| Maxillaria triangularis Lindl., 1845 |
| Maxillaria tuerckheimii Schltr., 1912 |
| Maxillaria turialbae Schltr., 1918 |