| Malaxis hintonii Todzia, 1993 |
| Malaxis histionantha (Link, Klotzsch & Otto) Garay & Dunst., 1976 |
| Malaxis ichthiorrhyncha A. Rich. & Galeotti, 1845 |
| Malaxis javesiae (Rchb. f.) Ames, 1922 |
| Malaxis johniana (Schltr.) Foldats, 1959 |
| Malaxis lankesteri Ames, 1923 |
| Malaxis lepanthiflora (Schltr.) Ames, 1922 |
| Malaxis lepidota (Finet) Ames, 1922 |
| Malaxis lindeniana A. Rich. & Galeotti, 1845 |
| Malaxis linguella (Rchb. f.) Ames, 1922 |
| Malaxis lizbethiae R. González & E. Ramírez, 2008 |
| Malaxis longisepala (Ridl.) Kuntze, 1891 |
| Malaxis luceroana R. González, 1992 |
| Malaxis lyonnetii Salazar, 1997 |
| Malaxis macrantha Ames, 1908 |
| Malaxis macrostachya (Lex.) Kuntze, 1891 |
| Malaxis macvaughiana R. González, Lizb. Hern. & E. Ramírez, 2008 |
| Malaxis magniauriculata Salazar, R. Jiménez & Castañeda-Zárate, 2024 |
| Malaxis maguirei C. Schweinf., 1948 |
| Malaxis maianthemifolia Schltdl. & Cham., 1831 |