| Lonchocarpus amerimnum DC., 1825 |
| Lonchocarpus andrieuxii M. Sousa, 1992 |
| Lonchocarpus angusticarpus M. Sousa, 2009 |
| Lonchocarpus apricus Lundell, 1939 |
| Lonchocarpus argyrotrichus Harms, 1921 |
| Lonchocarpus atropurpureus Benth., 1860 |
| Lonchocarpus balsensis M. Sousa & J.C. Soto, 1989 |
| Lonchocarpus barbatus M. Sousa, E. Martínez & Ramos, 2011 |
| Lonchocarpus berriozabalensis Miranda ex M. Sousa, 2009 |
| Lonchocarpus bicolor M. Sousa, 1990 |
| Lonchocarpus brachyanthus M. Sousa, 2014 |
| Lonchocarpus brenesii M. Sousa, 2009 |
| Lonchocarpus castilloi Standl., 1932 |
| Lonchocarpus caudatus Pittier, 1917 |
| Lonchocarpus chavelasii M. Sousa ex Cruz Durán & G. Andrade, 2021 |
| Lonchocarpus chiapensis Lundell, 1946 |
| Lonchocarpus cochleatus Pittier, 1917 |
| Lonchocarpus comitensis Pittier, 1917 |
| Lonchocarpus congestiflorus M. Sousa & J. Linares, 2011 |
| Lonchocarpus constrictus Pittier, 1917 |