| Arachnothryx scoti (Lorence) Borhidi, 1995 |
| Arachnothryx secundiflora (B.L. Rob.) Borhidi, 1982 |
| Arachnothryx septicidalis (B.L. Rob.) Borhidi, 1982 |
| Arachnothryx sessilis Borhidi & G. Ortíz, 2006 |
| Arachnothryx sinaloae Borhidi, 2004 |
| Arachnothryx skutchii (Standl. & Steyerm.) Borhidi, 1987 |
| Arachnothryx sooiana Borhidi, 2003 |
| Arachnothryx sousae Borhidi, 2004 |
| Arachnothryx stachyoidea (Donn. Sm.) Borhidi, 1982 |
| Arachnothryx subglabra Borhidi & N.C. Jiménez, 2006 |
| Arachnothryx tabascensis Borhidi, 2004 |
| Arachnothryx tacanensis (Lundell) Borhidi, 1987 |
| Arachnothryx tenorioi (Lorence) Borhidi, 1995 |
| Arachnothryx tenuisepala Borhidi, 2003 |
| Arachnothryx tuxtlensis (Lorence & Cast.-Campos) Borhidi, 1989 |
| Arachnothryx uxpanapensis (Lorence & Cast.-Campos) Borhidi, 1989 |
| Arachnothryx villosa (Hemsl.) Borhidi, 1982 |
| Arachnothryx vulcanicola (Standl. & Steyerm.) Borhidi, 1987 |
| Arachnothryx wendtii (Lorence & Cast.-Campos) Borhidi, 1995 |
| Arachnothryx yucatanensis (Lundell) Borhidi, 1989 |