| Cyperus dussii Boeckeler, 1890 |
| Cyperus echinatus (L.) Alph. Wood, 1861 |
| Cyperus efoliatus Boeckeler, 1895 |
| Cyperus eggersii Boeckeler, 1888 |
| Cyperus ehrenbergianus Boeckeler, 1870 |
| Cyperus ehrenbergii Kunth, 1837 |
| Cyperus elatus Rottb., 1773 |
| Cyperus elegans L., 1753 |
| Cyperus elegans subsp. elegans L., 1753 |
| Cyperus engelmannii Steud., 1854 |
| Cyperus entrerianus Boeckeler, 1878 |
| Cyperus eragrostis Lam., 1791 |
| Cyperus erythrorhizos Muhl., 1817 |
| Cyperus erythrorhizos var. cupreus (J. Presl & C. Presl) Kük., 1935 |
| Cyperus esculentus L., 1753 |
| Cyperus esculentus var. angustispicatus Britton, 1886 |
| Cyperus esculentus var. esculentus L., 1753 |
| Cyperus esculentus var. heermannii (Buckley) Britton, 1886 |
| Cyperus esculentus var. macrostachyus Boeckeler, 1870 |
| Cyperus esculentus var. phymatodes (Muhl.) Kük., 1926 |