Description
Se presentan las relaciones filogenéticas de las especies mexicanas de Vanilla, con base en caracteres moleculares de la región ITS de los genes ribosomales. Las 10 especies de vainillas mexicanas pertenecen a linajes distintos del género, aunque 8 forman parte del clado que incluye a las especies económicamente más importantes (V. planifolia y V. pompona) y representan una parte importante de los recursos genéticos secundarios de este cultivo. Se hicieron evaluaciones de la variación de los ITS y se determinó que su secuencia es específica para cada taxón y que constituye una herramienta útil para el reconocimiento de material estéril dentro de este grupo. Los recursos genéticos primarios de vainilla están conformados por los cultivares y especimenes silvestres de V. planifolia. Se obtuvieron secuencias nucleotídicas de regiones genómicas supuestamente hipervariables con objeto de colectar datos que permitieran establecer una genealogía en esta especie y contestar preguntas acerca del origen, diseminación y procesos de domesticación en este cultivo. Las secuencias obtenidas (parciales de los genes Adh, CaM y GapC4), muestran nula o poca variación, aunque en uno de los casos ésta es informativa y aparentemente permite reconocer clones y sitios de origen de los especimenes. Sin embargo, la variación hasta ahora detectada es insuficiente para realizar un análisis que brinde mayor información sobre la historia de V. planifolia. Se presentan los resultados de un estudio sobre la variación y estructura genética, de las plantaciones e individuos silvestres conocidos de V. planifolia, para lo cual se utilizaron datos de 15 loci electroforéticos polimórficos. Todas las localidades presentan valores bajos en niveles de heterocigosis (Ho=0.000 a 0.078). Distintos análisis: Fst, análisis fenéticos y de parsimonia, indican una estructura de muy definida a poco definida, pero existe. La variación está repartida principalmente en dos áreas distintas, el norte de Oaxaca y el norte de Veracruz, aunque individuos aislados de localidades de Tabasco, este de Oaxaca y Chiapas pueden ser muy diferentes electroforéticamente. Los índices de fijación (F) son positivos, muy altos y cercanos a 1, y difieren significativamente del esperado para un entrecruzamiento al azar. Los datos sugieren que ha existido endogamia. Se presentan valores de flujo génico y de tasas de entrecruzamiento; el flujo génico es bajo y el sistema de reproducción dominante es la autofertilización. Los valores de diversidad genotípica no reflejan la existencia de una extensa propagación clonal y sugieren que las técnicas de electroforesis están sobrestimando el número de genotipos existente. Por último se señalan algunas observaciones sobre el manejo de los recursos genéticos de las vainillas cultivadas, indicándose rasgos deseables de otras especies mexicanas silvestres susceptibles de ser incorporados a este cultivo. La conservación de los recursos genéticos de Vanilla planifolia requiere principalmente de un plan de manejo ex situ, debido a las condiciones críticas de conservación de esta especie en estado silvestre. Se recomienda la creación de un banco de germoplasma y el mejoramiento de las condiciones en las plantaciones, especialmente en Oaxaca, como una estrategia para el mantenimiento de la diversidad genotípica en las plantaciones.
Reino: 1 Filo: 1 Clase: 1 Orden: 1 Familia: 1 Género: 3 Especie: 10 Epitetoinfraespecifico: 4
Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 142 records.
This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.
Versions
The table below shows only published versions of the resource that are publicly accessible.
How to cite
Researchers should cite this work as follows:
'Soto-Arenas M.A. 1999. Filogeografía y recursos genéticos de las vainillas de México. Instituto Chinoin A. C. Bases de datos SNIB-CONABIO, proyecto J101. México, D. F.'
Rights
Researchers should respect the following rights statement:
The publisher and rights holder of this work is Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad. This work is licensed under a Creative Commons Attribution (CC-BY 4.0) License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: c043cf3a-abb9-4039-bf5d-e2ae3a22e245. Comisión nacional para el conocimiento y uso de la biodiversidad publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Biodiversity Information System of Mexico.
Keywords
Occurrence; Plantas; Occurrence
External data
The resource data is also available in other formats
SNIB-J101-CSV.zip | http://www.snib.mx/proyectos/J101/SNIB-J101-CSV.zip UTF-8 CSV |
---|---|
SNIB-J101-BD.zip | http://www.snib.mx/proyectos/J101/SNIB-J101-BD.zip UTF-8 MDB MicrosoftAccess2007 |
Contacts
- Originator
- Responsable
- Lago Tangañica # 18
- Tel 5262 3193 (con la Srita. Nora), 294 2862, 262 3101, 294 2863, 622 9013 Fax 531 4349
- Metadata Provider
- Dirección General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
- Point Of Contact
- Dirección General de Sistemas
- Liga Periférico-Insurgentes Sur No. 4903, Col. Parques del Pedregal
- 50045000
Geographic Coverage
País: MEXICO (CAMPECHE, CHIAPAS, OAXACA, PUEBLA, QUINTANA ROO, SAN LUIS POTOSI, TABASCO, TAMAULIPAS, VERACRUZ DE IGNACIO DE LA LLAVE)
Bounding Coordinates | South West [16.113, -100.061], North East [23.227, -88.612] |
---|
Taxonomic Coverage
Reino: Plantae Filo: Tracheophyta Clase: Equisetopsida Orden: Asparagales Familia: Orchidaceae
Kingdom | Plantae |
---|---|
Phylum | Tracheophyta |
Class | Equisetopsida |
Order | Asparagales |
Family | Orchidaceae |
Genus | Vanilla, Palmorchis, Paphiopedilum |
Species | Vanilla planifolia (bainii (Zapoteco), canela de cuya, cashisha (Totonaco), caxi-xanath (Totonaco), juju, kuoley gm (Chinanteco), piis'oxaanti (Tepehua), siisbik (Maya), sisbik (Maya), sisbik-k'aax (Maya), sumi xa'nat (Totonaco), sumi'xa'nat (Totonaco), sunti'xa'nat (Totonaco), tlilxóchitl (Náhuatl), vainilla, vainilla colibrí, vainilla escarchada, vainilla mansa, xuucy (Mixe), zizbic (Maya)), Vanilla insignis (sisbik (Maya), vainilla, vainilla cimarrona), Vanilla pompona (platanillo, plátano vainilla, segne-xeute (Totonaco), vainilla, vainilla boba, vainilla pompona, vainillán, vainillón), Vanilla cribbiana (vainilla), Vanilla inodora (vainilla, vainilla cerro amarillo, vainilla de puerco), Paphiopedilum fairrianum, Vanilla perplexa, Vanilla odorata (vainilla, vainilla de Teutila, vainilla de Tlatepusco), Vanilla phaeantha (vainilla), Vanilla grandiflora (platanillo, plátano vainilla, segne-xeute (Totonaco), vainilla, vainilla boba, vainilla pompona, vainillán, vainillón) |
Infraspecificname | Vanilla planifolia cv. mansa, Vanilla planifolia cv. oreja de burro, Vanilla planifolia cv. acamaya, Vanilla pompona cv. acamaya |
Temporal Coverage
Start Date / End Date | 1994-05-11 / 1999-01-27 |
---|
Project Data
Se presentan las relaciones filogenéticas de las especies mexicanas de Vanilla, con base en caracteres moleculares de la región ITS de los genes ribosomales. Las 10 especies de vainillas mexicanas pertenecen a linajes distintos del género, aunque 8 forman parte del clado que incluye a las especies económicamente más importantes (V. planifolia y V. pompona) y representan una parte importante de los recursos genéticos secundarios de este cultivo. Se hicieron evaluaciones de la variación de los ITS y se determinó que su secuencia es específica para cada taxón y que constituye una herramienta útil para el reconocimiento de material estéril dentro de este grupo. Los recursos genéticos primarios de vainilla están conformados por los cultivares y especimenes silvestres de V. planifolia. Se obtuvieron secuencias nucleotídicas de regiones genómicas supuestamente hipervariables con objeto de colectar datos que permitieran establecer una genealogía en esta especie y contestar preguntas acerca del origen, diseminación y procesos de domesticación en este cultivo. Las secuencias obtenidas (parciales de los genes Adh, CaM y GapC4), muestran nula o poca variación, aunque en uno de los casos ésta es informativa y aparentemente permite reconocer clones y sitios de origen de los especimenes. Sin embargo, la variación hasta ahora detectada es insuficiente para realizar un análisis que brinde mayor información sobre la historia de V. planifolia. Se presentan los resultados de un estudio sobre la variación y estructura genética, de las plantaciones e individuos silvestres conocidos de V. planifolia, para lo cual se utilizaron datos de 15 loci electroforéticos polimórficos. Todas las localidades presentan valores bajos en niveles de heterocigosis (Ho=0.000 a 0.078). Distintos análisis: Fst, análisis fenéticos y de parsimonia, indican una estructura de muy definida a poco definida, pero existe. La variación está repartida principalmente en dos áreas distintas, el norte de Oaxaca y el norte de Veracruz, aunque individuos aislados de localidades de Tabasco, este de Oaxaca y Chiapas pueden ser muy diferentes electroforéticamente. Los índices de fijación (F) son positivos, muy altos y cercanos a 1, y difieren significativamente del esperado para un entrecruzamiento al azar. Los datos sugieren que ha existido endogamia. Se presentan valores de flujo génico y de tasas de entrecruzamiento; el flujo génico es bajo y el sistema de reproducción dominante es la autofertilización. Los valores de diversidad genotípica no reflejan la existencia de una extensa propagación clonal y sugieren que las técnicas de electroforesis están sobrestimando el número de genotipos existente. Por último se señalan algunas observaciones sobre el manejo de los recursos genéticos de las vainillas cultivadas, indicándose rasgos deseables de otras especies mexicanas silvestres susceptibles de ser incorporados a este cultivo. La conservación de los recursos genéticos de Vanilla planifolia requiere principalmente de un plan de manejo ex situ, debido a las condiciones críticas de conservación de esta especie en estado silvestre. Se recomienda la creación de un banco de germoplasma y el mejoramiento de las condiciones en las plantaciones, especialmente en Oaxaca, como una estrategia para el mantenimiento de la diversidad genotípica en las plantaciones.
Title | Filogeografía y recursos genéticos de las vainillas de México |
---|---|
Identifier | SNIB-J101-Varios archivos XLS-ND |
Funding | Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO) |
Study Area Description | Plantas con flores como agapantos, ajos, azafránes, cebollas, espárragos, gladiolas, magueyes, orquídeas, patas de elefante, sábilas, vainillas, yucas |
The personnel involved in the project:
- Content Provider
Collection Data
Collection Name | NO DISPONIBLE |
---|---|
Collection Identifier | SNIB-J101-Varios archivos XLS-ND |
Parent Collection Identifier | NO APLICA |
Specimen preservation methods | Deep frozen |
---|
Curatorial Units | Between 1 and 25 Ejemplar |
---|
Additional Metadata
Alternative Identifiers | c043cf3a-abb9-4039-bf5d-e2ae3a22e245 |
---|---|
https://www.snib.mx/iptconabio/resource?r=SNIB-J101 |